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系统发育比较分析—R

1、系统发育独立差（Phylogenetic Independent Contrast， PIC）是去除性状分析中物种系统发育关系的一种方法，是美国进化生物学家 J. Felsenstein于1985年提出的。 参考链接 当时，有动物学家检验了若干哺乳动物脑容量和体重的相关性。

2、系统发育树的分析及解读如下：要点 系统发育树是表示生物体之间进化关系的图表。系统发育树是假设的，而不是确定的事实。系统发育树中的分支模式反映了物种或其他群体如何从一系列共同祖先进化而来的关系。

3、不可以，年龄太小了。小儿的神经系统的发育，重要的是脑的发育。新生儿脑重约390克，约占出生体重的8％，而成人的脑重约1400克，占体重的4％。

4、①一般型：包括全身肌肉、骨骼、脏器和血液，其生长模式，大致与形态指标（身高、体重等）相同，生长期内具有两个突增高峰。②神经系统型：脑、脊髓、视觉器官以及反映大脑大小的头围、头径等。

5、婴幼儿生长发育有连续性和阶段性，年龄越小体格增长越快。生后6个月内生长最快，尤其在出生3个月内。各系统器官发育不平衡。各系统发育快慢与不同年龄生理功能有关。神经系统发育先快后慢，生殖系统先慢后快。

6、遗传：遗传因素对小儿的生长发育有一定影响。如父母身材的高矮、皮肤的颜色、毛发的多少以及形态等，对子女都有一定程度的影响。

系统发生树

1、系统发生树（英文：phylogenetic tree或evolutionary tree）是表明被认为具有共同祖先的各物种相互间演化关系的树，又被译作系统发育树、系统演化树、系统进化树、种系发生树、演化树、进化树、系统树。

2、【答案】：（1）用基于距离的方法构建系统发生树，如UPGMA方法。（2）基于字母特征构建进化树。基于字母特征的方法是通过对利用序列比对得到的亲缘关系所构建的候选树的进一步分析来构建进化树。（3）最大吝啬法（MP）。

3、系统发生树（英文：Phylogenetic tree）又称为演化树（evolutionary tree），是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树。是一种亲缘分支分类方法（cladogram）。

4、我们可以修改为 Bootstrap method ，通常为100的倍数，设定 500 。通过该检验方法得到的系统发生树的每个节点都会标记一个数字，它代表了指定次数次所得到的系统发生树都百分之多少都有该节点，一般 70% 才可信。

系统发育树的分析及解读

分析系统发育树的步骤如下：观察树的结构：观察系统发育树的结构，了解其分支和节点的排列方式。树的分支代表不同的物种或类群，节点代表之间的演化关系。

在有根树中，有一个叫根（root）的特殊结点，用来表示共同的祖先，由该点通过唯一途径可产生其他结点；有根树是具有方向的树，包含唯一的节点，没有确认共同祖先或进化途径。

系统发育树也称为系统发生树、聚类树或者进化树，以树状结构表示各个节点的进化和亲缘关系，可用来描述物种之间的进化关系，在系统发育分析、基因家族和物种进化分析中经常会看到此类图片。

系统发育树分有根（rooted）和无根（unrooted）树。有根树反映了树上物种或基因的时间顺序，而无根树只反映分类单元之间的距离而不涉及谁是谁的祖先问题。这个需要看你的构建的发育树具体参数怎么设置的。

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